除菌过滤在药品生产中扮演着至关重要的角色，它不仅是非最终灭菌注射剂去除微生物的唯一手段，对于保证产品质量和安全同样不可或缺。药企面对这一挑战，首要任务就是如何精心选择合适的除菌过滤器。这一过程基于几个关键原则：首先，过滤材料必须与被处理成分无吸附作用且不会释放有害物质；其次，过滤器应具备良好的完整性，以便通过科学检测如气泡点测试、单向流试验等来确保其效能；最后，所选的过滤器需能够承受高温蒸汽灭菌并通过严格的微生物截留试验。
为了确定最佳工艺流程，一系列的小试实验和中试放大实验将被进行，这包括使用多层膜片筛选、囊式过滤器及表面过滤组合优化。此外，在深层過濾階段，可選擇成本較低且有效率高的钛棒過濾媒介，其孔径可设定为10μm、5μm或3μm。而表面過濾階段，则采用聚醚砜或聚丙烯材质，其孔径通常設為0.6μm、0.45μm或0.2μm。最後，用於末端膜過濾的是具有最高過濾效率的大型膜片，此类材料往往採用聚醚砜材质，並設定孔径為0.2μm或更小以達到最終清潔效果。
