在大气治理的严厨中，船舶燃油中的硫成分几乎占90%，在发动机内通过燃烧与氧气反应，最终以二氧化硫的形式排放到尾气中。但是，船舶的大气污染防治问题涉及众多主体，必须各方携手合作，将减排作为共同目标。随着陆上污染源的减少，水运行业被认为有巨大的减排潜力。中国船舶航运业的快速发展虽然带来了贸易便利，但也给区域空气质量造成了压力。
研究显示，长三角、珠三角、环渤海和长江等沿海沿江地区，船舶港口排放已成为大气污染的一个重要来源。尽管港口通常位于城市中心区以外，其对空气质量影响容易被忽视，但由于使用高硫含量燃料油和柴油，以及大量机械设备导致的颗粒物和氮氧化物排放，使得这一点变得不容忽视。
为了应对这一挑战，一份更为严格的管控方案《船舶排放控制区调整方案(征求意见稿)》已经完成意见征集，该方案旨在将现有的三个水域扩大至全国范围，并增加生活污水排放控制指标。此外，《打赢蓝天保卫战三年行动计划》提出推进船舶更新升级，其中明确2019年底前需要调整扩大船舶排放控制区范围。
标准制定方面，《船用燃料油》《船舶发动机排气污染物限值及测量方法(中国第一、二阶段)》等标准相继落地。在VOCs方面，对于2020年以后建造或进入航道且150总吨以上中国籍油轮需具备回收条件并鼓励使用。而国内首个针对船 船的大气排放标准已经实施3月有余。
专家表示，即使征求意见稿将控制区范围扩展至12海里，也仍然显得“捉襟见肘”，因此需要进一步完善监管措施，如提高检测难度以及加强其他类型污染物限制。此外，由于一些炼油厂添加调和剂提高重油品质，这也使得其在总体上升降低成本的手段，而这反过来又可能导致更多环境问题产生。
