生态系统平衡破坏
水污染是对生态系统最直接的威胁之一。工业废水、农业化学肥料和农药、城市排放等各种污染物进入河流湖泊，导致生物多样性的急剧下降。在自然环境中，微生物、植物和动物共同构成了一个复杂的食物链网络，但随着水质恶化，这些生物在其所依赖的栖息地逐渐消失。
人类健康风险
人类通过饮用受污染的地下水或进食含有重金属和有机污染物的大米、鱼类等，面临着各种健康问题。长期暴露于高浓度铅、汞、砷等重金属会引起神经系统疾病，如智力低下、高血压以及肝脏和肾脏功能障碍。此外，一些化学农药残留在食品中，也可能导致癌症、中毒甚至死亡。
经济损失与社会影响
经济上，由于土壤质量恶化，使得农业生产力下降，而后又加大了种植成本，从而影响了粮食安全。而对于旅游业来说，受污染的地理景观不仅损害了自然风光，还使得游客数量减少，对当地经济造成严重打击。此外，居民因生活用水质量问题而增加医疗费用，也间接影响到整个社会经济发展。
水资源短缺与能源消耗
由于工业废弃液体排放大量回收不到，所以这些无形之手中的“金子”即便转化为可再生资源也需要巨大的能量投入。这意味着更多的人口必须前往更远的地方寻找清洁水源，同时还要面对能源消耗的问题。同时，以往可以利用湿地过滤净化自来水现今变得困难，这进一步加剧了能源需求。
环境恢复难度增大
一旦环境受到极端破坏，其修复工作将变得异常艰巨且昂贵。一旦达到某个不可逆转点，即使采取一切措施去治理，也很难完全恢复原有的生态平衡。这不仅需要庞大的资金投入，而且还涉及长时间周期内持续不断的干预活动。如果没有适当政策支持，以及公众意识提高，那么我们可能永远无法真正解决这个问题。
