选择合适的滤膜，关键在于考虑其与液体之间的化学相容性。尼龙膜和亲水PTFE膜因其广泛的化学适应性，主要应用于HPLC相关的过滤工作，对水性溶液和有机溶液均有良好表现。亲水PVDF和PES膜则由于低蛋白吸附特性，更适用于蛋白溶液以及温和有机溶剂的过滤。疏水PTFE膜以其广泛化学适应性而被用来过滤各种有机溶剂，而MCE膜则是专为处理水性溶液而设计。
聚醚砜（PES）滤芯采用德国进口材料，具有高亲水性能、低蛋白吸附，并提供绝对精度，以便进行含氮基质物质除菌过滤。
聚四氟乙烯（PTFE）滤芯分为亲水型和疏水型，都具备绝对精度，其广泛的化学相容性使它们在气体除菌、酸碱类及多种有机溶剂过滤中发挥作用。
聚偏二氟乙烯（PVDF）也存在亲水型和疏水型，它们同样拥有绝对精度，能够处理气体除菌以及多种强腐蚀性的酸碱类及其他各种化合物。
尼龙（N6或N66）带电荷膜，因其独特结构，可以有效地去除杂质并实现更好的洁净效果，是理想选择用于包括有机介质在内的一系列流程中的净化工作。
聚丙烯（PP）的使用范围较宽，有着较高的相对精度，可用于澄清各类流体、预过滤颗粒杂质以及执行更细腻的流动环境下需要进一步纯化时所需的小流量操作。
混合纺素（MCE）的亲水性能使它成为处理含氮基质物品尤其是生物样本等情况下的理想选择之一，同时这种材料亦能提供极佳之排斥力以防止微生物污染，从而保障实验结果之准确无误。
活性炭纺素模块不仅能促进反应过程，还可去除异味、色泽，因此常被用作脱色或去味等功能上的应用；玻璃纺素模块虽然没有活性炭那样显著作用，但却能够作为一道前置筛选设备，即可起到预筛浊垢悬浮固态颗粒的手段，同时对于气体传递系统来说也有其特殊价值。
