通常，除菌过滤验证不仅要确保除菌过滤器本身的性能，也必须对整个过滤工艺进行严格的验证。这些两个方面是相互补充但又不能替代的，它们需要独立进行。关于除菌过滤器本身的性能确认，通常由制造商负责，这包括了微生物截留能力、完整性测试、生物安全性评估（毒性和内毒素）、流速和压力测试、多次灭菌实验、可提取物释放分析以及颗粒和纤维释放检测等多项检验。
至于过滤工艺验证，则是针对特定的介质和具体操作条件进行的实践过程。这一过程可能包括细菌截留试验、化学兼容性的评估、产品中的可提取或溶出物质检测，以及安全性评估和吸附效率分析等。此外，如果产品经过处理后需要通过完整性测试，那么还需进一步考察相关产品完整性的证明。在实际应用中，不论是生产者还是委托机构（如第三方试验室），都可以完成这一部分工作，但最终责任人应确保在验证时已考虑并覆盖了所有可能出现的情况，并能提供相应文件作为证据。
