选择合适的滤膜，关键在于它与液体之间的化学相容性。尼龙膜和亲水PTFE膜因其广泛的化学稳定性，常用于HPLC相关过滤，可处理水性溶液和有机溶液。亲水PVDF和PES膜由于低蛋白吸附特性，主要应用于蛋白质溶液过滤，也可用于温和有机溶剂处理。而疏水PTFE膜则以广泛化学相容为特点，以便更有效地过滤有机溶剂。MCE膜多用作水性溶液筛选与分析监测。
具体而言，聚醚砜（PES）型滤芯采用德国进口材料，其高亲水性能、低蛋白吸附率确保了绝对精度，对于清洁纯净的水性物质除菌工作尤为适宜。此外，还有一系列其他类型如聚四氟乙烯（PTFE）、聚偏二氟乙烯（PVDF）以及尼龙等材质的滤芯，它们各自具备独特的优势，如绝对精度、高化学稳定、分离效能等。
最后，不同情况下也会涉及到聚丙烯（PP）、混合纤维素（MCE）、活性炭纤维（ACF）以及玻璃纤维（GF）的使用，这些材料各具特色，比如相对精度、抗污染能力或是气体处理能力，都能够满足不同领域内各种复杂且挑剔的过滤需求。
