技术问题：传统处理方式不适应新情况
农村地区由于人口分布稀疏，基础设施薄弱，导致传统的集中式污水处理站难以有效覆盖。这些传统的处理方法往往无法满足农村生活污水排放量和质量要求，同时也缺乏高效节能的特性。因此，需要开发出更为灵活、高效且适应小型化、分散化排泄源需求的处理技术，以解决农村地区面临的问题。
资金问题：建设成本高昂
农村生活污水治理项目所需资金投入较大，包括设备购置、运营维护等费用，这对地方财政压力很大。在许多贫困乡镇，由于财政能力有限，对于投资建设现代化污水处理设施感到犹豫，不少项目因缺乏资金而被迫搁浅或推迟。此外，由于农民居民户数众多，每个家庭自行建造独立式雨淋缸或简易厕所，也增加了家庭经济负担。
管理问题：监管体系不完善
农村地区由于地广人稀，加之基层行政力量相对薄弱，一些地方在实施生活污水治理政策时缺乏有效执行力度。一些规章制度虽然存在，但在实际操作中却遭遇到种种障碍，如信息沟通不足、监督机制落后以及执法人员培训不足等，这些都影响了整体治理效果。同时，在一些偏远山区或岛屿区域，因为交通不便及地形复杂，使得开展有效监管变得更加棘手。
知识普及问题：公众意识淡薄
对于如何正确使用和维护个人卫生设施，以及如何合规排放废物，很多农民居民仍然知之甚少。这部分是因为教育资源在乡镇分配上并不均衡，而且对于环境保护知识普及工作还未得到充分重视，因此公众参与度低，对生活垃圾分类和废弃物处置没有良好的习惯形成。而这直接影响到了整个生态环境保护和城乡融合发展。
政策协调问题：跨部门合作需加强
生活污水治理是一个涉及多个部门如农业、环保、住房城乡建设等领域的大型工程，其成功完成需要各相关部门之间紧密协作。在现实操作中，由于不同部门之间职责界定模糊以及协调机制不够完善，有时候会出现责任移交或者工作割裂的情况，从而严重影响了项目进展速度与效果。此外，与企业合作方面，也需要有更明确的合作模式，为企业提供稳定的市场支持，以促进产业健康发展。
