在药品生产的精细工艺中，除菌过滤不仅是确保产品安全性的关键措施，也是实现注射剂非最终灭菌状态下微生物清洁的唯一手段。对于生产企业而言，选择合适的除菌过滤器是一个既复杂又重要的决策过程。其核心原则在于确保过滤材料与被处理成分之间存在良好的相容性和无吸附作用，同时保证过滤器的完整性能够通过科学检测，如气泡点检验和单向流试验等，以排除任何潜在缺陷。此外，所选除菌过滤器必须能够承受121℃高温蒸汽灭菌，并且通过严格的微生物截留试验。
为了找到最佳的生产工序配置，通常需要先进行一系列小规模实验来测试不同类型膜片，然后利用囊式过滤器进行中规模实验放大，以确定最适合当前工艺条件下的具体型号。在生物制药领域，更是常见对整个过滤组合进行优化以提高载量并降低成本。这包括在膜层之前加入深层和表面过滤器。深层过滤器如钛棒因其低成本和有效澄清能力，而经常被选为具有较大容量的大型深层筛选设备，其孔径可设定为10μm、5μm或3μm。而表面筛选使用聚醚砜或聚丙烯材质，由于成本相对较低，它们主要用于预筛，在膜层前端起到预处理作用，其孔径可设定为0.6μm、0.45μm或0.2μm。最后，一般采用更昂贵但拥有最大筛网率性能的地胶膜作为末端悬浮物去除步骰，即聚醚砜材质，其孔径设置为0.2μm或0.1μm，为达成最终清洁效果提供了坚实保障。
