农村地区的基础设施建设落后，导致污水处理能力不足。许多农村居民在没有合适的排泄设施的情况下，只能将废水直接排放到环境中，特别是在雨季或洪峰期，这些未经处理的废水会通过沟渠和河流迅速扩散到更广阔的区域，造成严重的环境污染。有的农户为了节省成本，不愿意投资购买高效的厕所设备，他们往往选择使用简易式或传统式卫生设施，如茅坑、土坑等，这些都难以有效地隔离并处理人体排泄物。
农民对健康安全知识了解不够，行为习惯差异显著。在一些偏远乡镇，由于缺乏普及性的教育和宣传活动，大多数农民对于如何正确处理生活垃圾和废水持有模糊甚至错误认识。此外，一些出于迷信或者观念上的原因，部分农民仍然认为将生殖器官残余带入田间可以增进作物生长，从而无意识地把这些有害物质释放到了自然环境中。
政府投入不足，加上监管力度有限。虽然政府近年来已经开始关注农业面源污染的问题，并采取了一系列措施，比如提供补贴支持新型环保厕所、加强监管检查等，但由于资源有限，对于覆盖全国各个角落进行有效治理存在巨大挑战。同时，由于监督力度不足，一些地方政府可能因经济发展压力而优先考虑其他项目，从而忽视了对农业面源污染问题的整治工作。
技术创新与政策扶持需要进一步完善。目前市场上有一种新型环保厕所，它采用生物解毒技术，可以有效降低细菌数量，同时还具有较好的美观性和耐用性。但是，由于价格相对较高，使得普通农户难以接受。此外，即便有些地方政府提供一定程度的补贴，也无法覆盖所有贫困地区，因为这需要一个更加全面的政策体系支持，以及更多资金投入来推动这一技术向基层深入普及。
社区参与与公众意识提升至关重要。在解决这个问题时，还应鼓励社区成员积极参与到改善自己居住环境中的努力中去。这包括组织定期清洁行动、开展环保教育培训以及建立健全垃圾分类管理制度等。如果能够形成社会共识，并且每个人都承担起自己的责任，那么才能真正实现从根源上解决农业面源污染的问题。这也是一场长期而艰巨的斗争，但若要达到可持续发展目标，则必须由政府、企业以及公众三方面共同努力。
