采集与传输
农村地区的污水主要来源于家庭、畜牧场和工业活动。这些污水含有大量的有机物、养分和细菌等，对环境造成严重威胁。在进行处理之前，首先需要将这些污水采集起来，并通过管网或运输车辆将其送至处理设施。这一过程要求对管网系统的建设质量、高效的运输方式以及对人员安全性的考虑。
预处理
预处理是指在正式进入生化池之前，对污水进行的一系列物理、化学或者生物学操作。目的是去除大块固体物质，如木屑、衣物碎片等，以及部分油脂和悬浮物，这些都可能影响后续的生化反应。在农村地区，由于资金有限，常见的手段包括自然沉淀池、初级沉淀池以及简单的过滤设备。
生化处理
生化处理是指利用微生物消耗有机废弃物来降低BOD5（五日生化需氧量）值。这个过程中，微生物会分解入侵到下游水体中的营养盐类，从而减少对河流和湖泊中其他生活体产生毒害作用。在农村，可以采用小型活性슬udge反应器或厌氧罐进行这方面的工作。但由于技术门槛较高，这种方法在许多地方并未得到广泛应用。
脱氮与去磷
在一些较为发达的地方，为了进一步提高排放标准，还需要加入脱氮及去磷步骤。脱氮通常使用尿素法或者气相制备法，将氮转变成无害形式；去磷则可以通过化学药剂如白矾来实现，使得排放后的污染物更符合环保标准。然而，这些附加措施往往因为成本问题而难以实施，在资源紧张的情况下，更容易被忽略。
终末处置与再循环利用
处理完成之后，即便经过了多个阶段加工，但仍然存在一定量的问题，因此最后还需要考虑如何合适地处置剩余废液。此外，如果条件允许，还可以尝试将清洁后的废水用于灌溉作物，或作为冷却系统中的供暖源，以达到最大限度地回收资源价值。不过，由于卫生安全问题，这一部分工作也需格外谨慎，以免引起疾病传播风险。此外，对于某些特殊类型的农业生产，比如蔬菜种植，也需要特别注意防止病原微生物和病毒等危险因素，从而确保食品安全。
